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宿主细胞残留DNA样本前处理试剂盒 (磁珠法)
Cat No. SK030203D100
库存:现货
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产品介绍

本试剂盒用于生物制品样本的前处理,可稳定高效地获得样本中的微量宿主细胞DNA。适用于多种基质缓冲溶液,有效提取纯化微量的DNA。


可与各个 SHENTEK®宿主细胞(CHO、E.coli、Vero、酵 母、NS0、Human、MDCK、Sf9&AcNPV、Hi5&AcNPV、质粒、 SV40LTA&EIA 等)DNA qPCR 检测试剂盒配合使用。

n  试剂盒简介

宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒(磁珠法)用于生物制品样品的前处理,可稳定高效地获得样品中的微量宿主细胞 DNA。本试剂盒适用于多种基质缓冲溶液,有效提取纯化微量的 DNA。可与各个 SHENTEK®宿主细胞(CHOE.coliVero、酵母、NS0HumanMDCKSf9&AcNPVHi5&AcNPV、质粒、SV40LTA&EIA 等)DNA qPCR 测试剂盒配合使用。

本试剂盒可以手动操作,也可以通过 rHCDpurify®前处理系统实现样品的自动处理。rHCDpurify®中已内置相应处理程序,只需一键操作即可完成前处理。

n  试剂盒组分

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n 

100 Extractions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  实验所需但试剂盒中未含材料

Ø 无水乙醇(分析纯)

Ø 100%异丙醇(分析纯

Ø 1M HCl NaOH

Ø 5M NaCl

Ø PBS 缓冲液:pH 7.4、无镁离子和钙离子(如有必要,可用于稀释样品

Ø 一次性手套

Ø PCR 八联管或 96 孔板,相应管盖或覆膜

Ø 1000 μL100 μL10 μL 低吸附滤芯枪头

Ø 1.5 mL 低吸附离心管

n  相关设备

Ø 迷你离心机

Ø 磁性分离架和 rHCDpurify®前处理系统

Ø 漩涡振荡器

Ø 恒温金属浴

Ø 1000 μL100 μL10 μL 移液枪

Ø 荧光定量 PCR

Ø 超净台

Ø 96 孔微孔板混匀仪

n  实验操作流程

一、试剂、仪器准备

开启新试剂盒时需完成以下工作:

Ø  在新开启的洗涤液 A 中加入 40 mL 的无水乙醇。

Ø  在干净的试剂瓶中用无水乙醇和灭菌超纯水配制 70%乙醇溶液,标记为洗涤B

Ø  配制后的洗涤液应密封,室温保存,防止乙醇挥发(注意使用效期)。每次实验前需预先完成以下工作:

Ø  准备好 100%的异丙醇。

Ø  开启恒温金属浴,设置温度为 55 ℃70 ℃

Ø  蛋白酶 K 消化液配制:

使用前若发现蛋白酶 K 缓冲液出现结晶或沉淀,应 37金属浴处理,待完全溶解后,振荡混匀。

单个样品所需蛋白酶 K 消化液的准备(蛋白酶 K 使用量根据样品蛋白浓度可酌情增加):

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按照上述单个样品的蛋白酶 K 消化液用量和样品数,计算和配制本次实验所需的蛋白酶 K 消化液总体积。

蛋白酶 K 消化的完全程度会影响DNA 的回收检测。

Ø  工作结合液配制:

使用前若发现结合液出现结晶或沉淀,应 37 ℃金属浴处理,待完全溶解后,振荡混匀。

单个样品工作结合液的准备:200 μL 结合液 + 0.2 μL 酵母 tRNA +9 μL 糖原

如果是提取酵母 DNA 和 E.coli DNA,工作结合液中不要加酵母 tRNA。 

按照上述单个样品的工作结合液用量和样品数,计算和配制本次实验所需的工作结合液总体积。

二、样品准备

u  生物制品纯化过程中的上游中间样品(可能含有较高的 DNA  含量)

1) 先稀释后纯化:用 1×PBS(pH 7.4,无镁离子和钙离子)进行适当比例稀释后再进行样品纯化处理。

2)  先纯化后稀释:用稀释液对样品纯化后再进行稀释处理。

为了保证检测的准确性,使样品的检测值在标准曲线线性范围之内,高 DNA含量样品需要进行适当比例稀释处理(一般可考虑将高 DNA 含量样品稀释 100 倍或 1000 倍。

如果样品经过稀释,则用稀释液作为阴性对照。

u  干粉状态样品(选其一)

1)  样品溶解及纯化:用稀释液将干粉样品进行溶解,再进行样品纯化处理。

2) 样品溶解稀释及纯化:用适当的试剂将干粉样品溶解,配成高浓度溶液,再用稀释液稀释后,进行样品纯化处理。

一般可考虑将干粉样品稀释成 10 mg/mL 或 100 mg/mL。

u  pH 过高或过低样品

1)  要求:一般情况下生物制品纯化过程中间样品的 pH 值均为中性,若样品的pH<5>9,则会影响样品纯化处理效果。

2)  调节 pH:样品处理前先测试一下样品 pH 值,并可以用 1M 的 HCl 或 NaOH调整样品的 pH 至中性后(pH 6.0-8.0)再进行纯化操作。

u  对照样品处理

Ø  样品平行处理:为了确保结果的准确性,建议每个样品平行进行三次 DNA 提取处理和检测。

Ø  阴性对照NCS

每次实验中都需要设置一个 NCS 作为空白样品,NCS 与其他待测样品一起进行处理,以检验在样品处理过程中是否存在交叉污染或环境污染。

Ø  加标回收(ERC)

用 ERC 来评估 DNA 提取的效率、回收率和准确度,并可用 ERC 来评估验证分析方法和系统性能。对具体样品的 DNA 加标量设定在其无加标测试值的 2-10 倍为宜。

三、样品消化

1.        取 100 μL 待检测样品到 1.5 mL 干净的低吸附离心管中。

2.        在所有样品中,加入 10 μL 5M NaCl,振荡混匀。

3.        加入蛋白酶 K 消化液振荡混匀,55 ℃金属浴 1 小时。

为了使样品消化更加完全,可在孵育至 30 分钟左右时再次进行涡旋振荡混匀后继续孵育。

注意样品预处理好后需尽快进行下述的 DNA 提取实验!

四、DNA 提取

(一)操作过程(手工操作

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u 

1.        磁珠使用前应在漩涡振荡器充分振荡 5 秒。

2.        从金属浴中取出样品,快速离心 30 秒,每管样品中加入 209.2 μL 工作结合液,振荡混匀。

3.        快速离心 10 秒后在样品混合物中加入 200 μL 异丙醇,10 μL 磁珠。  如果样品较多,每次加入磁珠过程中应再次充分振荡混匀磁珠,以保证每次加入的磁珠量的一致性。

4.        将装有全部混合物的离心管置于漩涡振荡器上振荡 5 分钟,快速离心 10秒后静置于磁性分离架上。

快速离心的目的在于将附着在离心管盖和壁上的混合物甩至管底。

5.        待溶液澄清,磁珠完全分离后,用枪头小心移去上清。  等待磁珠完全分离的时间约为 3-5 分钟。

去除上清时枪头避免搅动磁珠,避免磁珠同上清一起被去除。

u 

1.        从磁性分离架上取下含有磁珠的离心管,加入 700 μL 洗涤液A,振荡 10秒使磁珠和洗涤液 A 混匀;快速离心 10 秒后,将离心管重置于磁性分离架上。待溶液澄清,磁珠完全分离后,用枪头移去上清液,完成第 1 次磁珠洗涤。

2.        从磁性分离架上取下含有磁珠的离心管,加入 700 μL 洗涤液 B,振荡 40秒使磁珠和洗涤液 B 混匀;快速离心 10 秒后,将离心管重置于磁性分离架上。待溶液澄清,磁珠完全分离后,用枪头移去上清液,完成第 2 次磁珠洗涤。

3.        为保证液体充分移除,可将离心管再次快速离心 10 秒,置于磁性分离架上,待磁珠完全分离后,用 10 μL 枪头小心的将残余液体吸除干净。

去除上清时枪头避免搅动磁珠,避免磁珠同上清一起被去除。

4.        从磁性分离架上取下离心管,打开管盖在室温下干燥 30 秒-3 分钟,除去残留的乙醇。

干燥时间依具体情况而定,室温较高或空气干燥的环境下可以选择较短干燥时间;而室温较低或空气湿润环境下,干燥时间可以稍长。

u 

1.        沿离心管壁加入 50-100 μL 70 ℃预热的洗脱液,用漩涡振荡器轻微振荡 5秒使磁珠和洗脱液混匀,70 ℃水浴 7 分钟,水浴过程中可再次振荡混匀 2-3次。

振荡后需将残留于管壁上的磁珠和洗脱液轻甩至管底。

振荡至管盖上的磁珠和洗脱液需快速离心后重新震荡混匀。

2.        孵育完成后,将离心管高速离心 1 分钟,然后静置于磁性分离架上,待磁珠分离后,用枪头小心转移溶液到干净的离心管中。

3.        将上一步获得的离心管快速离心 10 秒,然后静置于磁性分离架上,待磁珠分离后,用枪头再次转移溶液到干净离心管,所得即为样品纯化液。

收集洗脱液时,应将离心管内溶液转移完全,离心管内不得残留液体,否则将影响样品检测的准确性。

(二)操作过程(rHCDpurify®前处理系统

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u  提取准

按照下述 96 深孔板排布预先加入相应溶液:

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其中:

第 1 或 7 列:工作结合液 209.2 μL/孔,异丙醇 200 μL/孔以及消化后的全部样品

第 2 或 8 列:洗涤液A 700 μL/孔

第 3 或 9 列:洗涤液B 700 μL/孔

第 4 或 10 列:磁珠 15 μL/孔

第 5 或 11 列:洗脱液 100 μL/孔

消化后的样品可在其他试剂全部加完后再加。样品体积最大为 500 μL/孔。

u  程序启

1.        电源键打开—点击“登录”输入账号及密码—进入主页面。

2.        75%酒精棉球擦拭仪器内部—点击“紫外灯”—选择“15 分钟”。  此步骤可在提取准备操作之前进行

3.        将加好样的 96 深孔板放入仪器中固定位置,并把塑料套管插入磁头对应位置。

4.        点击“运行”—选择“rHCD-03D100”程序—扫描试剂盒上二维码—仪器运行。

5.        程序结束,发出“嘀嘀”声,立即取出深孔板,将样品纯化液全部转移到新的离心管内。

注意要

1.    DNA 洗涤和洗脱操作时,每次振荡混匀后,都应该短时间快速离心,以保证没有磁珠或液体附着于离心管盖或管壁上。

2.    在每一步操作时,用左手顺时针方向环握 EP 管,大拇指轻轻地打开管盖,勿将液体溅出。

3.    在磁性分离架上分离磁珠时,中途可以适当旋转离心管,使磁珠吸附更加集中。

4.    在去除乙醇干燥时,观察磁珠状态,勿让磁珠太干,以免洗脱时不完全溶解。

5.   请尽量在完成样品纯化处理当天进行后续的 DNA 检测,以保证检测结果的准确性。

附表

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修订时间:2023 05 29

生效日期:2023 06 01


 


保存条件

规定储存条件下24 个月,具体详见试剂盒标签

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