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疫苗制剂宿主细胞残留DNA样本前处理试剂盒(磁珠法)
Cat No. SK030206DM50
库存:现货
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产品介绍

n  试剂盒简介

本试剂盒的核酸提取纯化为磁珠法,针对疫苗制剂的产品特点,优化了试剂配方,用于疫苗成品,如 Vero 细胞生产的狂犬病疫苗中的 Vero 残留 DNA 的样品前处理,可稳定高效地获得样品中的痕量 DNA,可与各个 SHENTEK®宿主细胞 DNA qPCR 检测试剂盒配合使用。

本试剂盒可以采用手动操作,也可以通过 rHCDpurify®实现样品的自动处理。

如样品中含有铝佐剂或右旋糖苷,具体处理方法可咨询湖州申科生物技术股份有限公司。 

n  试剂盒组分

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n 

50 Extractions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  实验所需但试剂盒中未含材料

1.   无菌超纯水

2.   无水乙醇(分析纯)

3.   100%异丙醇(分析纯)

4.   5M 的 NaCl

5.   1M 的 HCl 和 NaOH

6.   1000 μL,100 μL,10 μL 无菌低吸附滤芯枪头

7.   1.5 mL 无菌低吸附离心管

8.   PCR 八联管或 96 孔板,相应管盖或覆膜

n  相关设备

1.  迷你离心机

2.  漩涡震荡器

3.  恒温水浴锅

4.  1000 μL,100 μL,10 μL 移液枪

5.  磁性分离架和 rHCDpurify®前处理系统

6.  荧光定量 PCR 仪

7.  96 孔微孔板混匀仪

n  实验操作流程

一、试剂、仪器准备

开启新试剂盒时需完成以下工作:

1.         在新开启的洗涤液 A 中加入 20 mL 的无水乙醇。

2.         在干净的试剂瓶中用无水乙醇和灭菌超纯水配制 70%乙醇溶液,标记为洗涤液 B。

3.         配制后的洗涤液应密封,室温保存,防止乙醇挥发。

每次实验前需预先完成以下工作:

4.         准备好 100%的异丙醇。

5.         使用前若发现结合液出现结晶或沉淀,应 37 ℃水浴,待完全溶解后,振荡混匀。

6.         使用前若发现样品缓冲液出现结晶或沉淀,应 37 ℃水浴,待完全溶解后,振荡混匀。

7.         使用前应提前将磁珠置于室温环境下平衡 10 分钟,使用前振荡均匀。

二、样品处理

如果待检测样品是生物制品纯化过程中的上游中间样品,可能含有较高的 DNA 含量。为了保证检测的准确性,使样品的检测值在标准曲线线性范围之内,可以用灭菌超纯水对高 DNA 含量样品进行适当比例的稀释后再进行样品纯化处理;也可以在样品纯化处理完成之后,用稀释液对纯化处理后的样品进行稀释,然后再进行 DNA 残留检测。

若样品为干粉状态,可用稀释液将干粉样品进行溶解,再进行下一步操作;或先用适当的试剂将干粉样品溶解,配成高浓度溶液,再用稀释液稀释后,进行下一步操作。

pH 值要求:一般情况下生物制品纯化过程中间样品的 pH 值均为中性,若样品的 pH<5>9,则会影响样品纯化处理效果。因此可用 1M 的盐酸或氢氧化钠调整样品的 pH 至中性后(pH6.0-8.0)再进行纯化操作。

u  对照样品处

Ø  阴性对照(NCS):每次实验中都需要设置一个 NCS 作为空白样品,NCS与其他待测样品一起进行处理,以检验在样品处理过程中是否存在交叉污染或环境污染。

Ø  加标回收(ERC):用 ERC 来评估 DNA 提取的效率、回收率和准确度,并可用 ERC 来评估验证分析方法和系统性能。对具体样品的 DNA 加标量设定在其无加标测试值的 2-10 倍为宜。

三、样品消化

1.  取 100 μL 待检测样品到 1.5 mL 干净的离心管中,加入 10 μL 5M NaCl、30μL

样品缓冲液,用漩涡振荡器充分震荡 30 秒,取出快速离心 5 秒。

2.  加入 15 μL 蛋白酶 K,在漩涡振荡器上充分震荡 10 秒,取出快速离心 5 秒,放置在 55 ℃水浴 1 小时。

四、DNA 提取

(一)操作过程(手工操作)

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u 

1.   将磁珠置于室温环境下 10 分钟,在漩涡振荡器充分振荡 5 秒。

磁珠可以根据实验量提前进行分装,避免环境温度反复导致结合能力降低。

2.   从水浴中取出样品,快速离心 30 秒,加入 200 μL 结合液,在漩涡振荡器上充分振荡 5 秒。

3.    快速离心 10 秒后在样品混合物中分别加入 200 μL 异丙醇,10 μL 磁珠。

4.    将装有全部混合物的离心管置于漩涡振荡器上振荡 5 分钟,快速离心 10 秒后静置于磁性分离架上。

快速离心的目的在于将附着在离心管盖和壁上的混合物甩至管底。

5.   待溶液澄清,磁珠完全分离后,用枪头小心移去上清。  等待磁珠完全分离的时间约为 3-5 分钟。

去除上清时枪头避免搅动磁珠,避免磁珠同上清一起被去除。

u 

1.    从磁性分离架上取下含有磁珠的离心管,加入 700 μL 洗涤液 A,用漩涡振荡器振荡 10 秒使磁珠和洗涤液 A 混匀;快速离心 10 秒后,将离心管重置于磁性分离架上。待溶液澄清,磁珠完全分离后,用枪头移去上清液,完成第 1 次磁珠洗涤。

2.    从磁性分离架上取下含有磁珠的离心管,加入 700 μL 洗涤液 B,用漩涡振荡器振荡 40 秒使磁珠和洗涤液 B 混匀;快速离心 10 秒后,将离心管重置于磁性分离架上。待溶液澄清,磁珠完全分离后,用枪头移去上清液,完成第 2 次磁珠洗涤。

3.    为保证液体充分移除,可将离心管再次快速离心 10 秒,置于磁性分离架上,待磁珠完全分离后,用 10 μL 枪头小心的将残余液体吸除干净。

去除上清时枪头避免搅动磁珠,避免磁珠同上清一起被去除。

4.    从磁性分离架上取下离心管,打开管盖在室温下干燥 1-3 分钟,除去残留的乙醇。 

干燥时间不可过长,室温较高或空气干燥的环境下可以适当缩短干燥时间,残留乙醇会影响下一步的检测反应。

u 

1.    沿离心管壁加入 50-100 μL 洗脱液,用漩涡振荡器轻微振荡 3 秒使磁珠和洗脱液混匀,70 ℃水浴 7 分钟,水浴过程中可再次振荡混匀 2-3 次。

振荡时不要将磁珠和洗脱液振到管盖上。

洗脱时应使洗脱液与磁珠充分混合均匀,避免磁珠附着于离心管盖和壁上导致未能充分混匀。

2.    孵育完成后,将离心管快速离心 30 秒,然后静置于磁性分离架上,待磁珠分离后,用枪头小心转移溶液到干净的离心管中。

3.    将上一步获得的离心管快速离心 10 秒,然后静置于磁性分离架上,待磁珠分离后,用枪头再次转移溶液到干净离心管,所得即为样品纯化液。

收集洗脱液时,应将离心管内溶液转移完全,离心管内不得残留液体,否则将影响样品检测的准确性。

(二)操作过程(rHCDpurify®前处理系统)

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u  提取准

按照下述 96 深孔板排布预先加入相应溶液:

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其中:

其中:

第 1 或 7 列:结合液 200 μL/孔,异丙醇 200 μL/孔,消化后的全部样品

第 2 或 8 列:洗涤液 A 700 μL/孔

第 3 或 9 列:洗涤液 B 700 μL/孔

第 4 或 10 列:磁珠 15 μL/孔

第 5 或 11 列:洗脱液 100 μL/孔

样品可在其他试剂全部加完后再加。

u  程序启

1.        电源键打开—点击“登录”输入账号及密码—进入主界面。

2.        75%酒精棉球擦拭仪器内壁—点击“紫外灯”—选择“15 分钟”。  

此步骤可在提取准备操作之前进行。

3.    将加好样的 96 深孔板放入仪器中固定位置,并把塑料套管插入磁头对应位置。

4.        点击“运行”—选择“rHCD-06DM50”程序—扫描试剂盒上二维码—仪器运行。

5.    程序结束,发出“嘀嘀”声,立即取出深孔板,将样品纯化液全部转移到新的离心管内。

注意要

1.        建议将实验室内部进行分区,分为阴性区(阴性对照样品处理、PCR 试剂的配制、阴性模板加样)、阳性区(样品操作)、扩增区等,做好明显的标识。每个区域配备独立的设备、试剂及耗材,不得交叉使用。实验试剂、待测样品、PCR 产物应分开存放,不应放于同处。减少在实验区内不必要的走动,以降低污染发生概率。

2.        实验开始前确保实验室环境温度不低于 22 ℃。

3.        实验过程中选择最合适尺寸的手套并及时更换,在不同实验区域或进行模板操作后都应更换实验服、口罩、帽子及手套,以避免不同实验区域交叉污染。

4.        装有试剂的离心管在打开之前应先瞬时离心,将管壁及管盖上的液体离至管底,降低污染手套或移液枪的风险;谨慎开关反应管,防止管内液体溅出或形成气溶胶导致污染。

5.        使用过的枪头及废液必须经过消毒液浸泡消毒后,在远离实验室的场所丢弃或统一处理。

6.        PCR 扩增完成后,需戴上一次性手套将 PCR 管取出,观察管盖是否紧闭,管壁有否破裂,确保产物没有外漏,之后丢弃在指定处,严禁开盖。

7.        在磁性分离架上分离磁珠时,过程中可缓慢旋转离心管,加速磁珠聚集。

8.        DNA 洗涤和洗脱操作时,每次振荡混匀后,都应该瞬时离心,以保证没有磁珠或液体附着于离心管盖或管壁上。

9.        在去除乙醇干燥时,观察磁珠状态,勿让磁珠太干,以免洗脱时不完全溶解。

10.    请尽量在完成样品纯化处理当天进行后续的 DNA 检测,以保证检测结果的准确性。

11.    rHCDpurify 程序启动前,检查 96 深孔板和套管是否固定好。

12.    rHCDpurify 仪器工作前及完成后需要紫外灭菌至少 15 分钟,并使用 75%酒精棉球将仪器内壁擦拭干净。且两次提取实验间隔至少为 30 分钟。

13.    rHCDpurify 程序运行完毕后,需立即取出 96 深孔板并将洗脱液转移至新的离心管。 96 深孔板第 5 或第 11 列壁上可能会出现冷凝水珠,该现象不会影响提取效果,只需将底部洗脱液转移出来即可,且保证多于 40 μL,确保检测时所需。

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修订日期:2023 05 15

生效日期:2023 05 17

 

 

 


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