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猪源残留DNA检测试剂盒 (PCR-荧光探针法)
Cat No. 1101113
库存:现货
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产品介绍

产品信息:

• 检测类型:定量检测

• 产品规格:100测试

• 适用样品类型:对各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中残留的猪源细胞DNA进行分析。

• 线性范围:30fg/μL~3000pg/μL;R2≥0.990;扩增效率为94.7%

• 样品回收率:50-150%

• LLOQ:3.00×10-2pg/μL

• 专属性:不受Bovine、293T、HEK293等常见工程细胞基因组DNA的干扰。

• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在30%以内。

• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。

• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、Roche LightCycler480


产品特点:

• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。

• 灵敏度高:定量下限低至3.00×10-2pg/μL,满足实际检测需求。

• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。

• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。


质量保证:

• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。

• 生产度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善。


n  试剂盒简介

SHENTEK®猪源残留 DNA 检测试剂盒是用于定量检测各种生物材料(如生物修复膜、生物补片、脱细胞基质等)中猪源 DNA 的专用试剂盒。

本试剂利用 PCR 荧光探针法原理,定量检测样品中残留的猪源 DNA。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。试剂盒配套有 Porcine DNA 定量参考品。本试剂盒与动物源性生物材料残留 DNA 提取试剂盒(磁珠法)配套使用。

n  试剂盒组

image.png 

n 

100 Reactions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  适用机型(包括但不限于

Ø SHENTEK-96S 实时荧光检测系统

Ø 7500 Real-Time PCR System

n  实验所需但试剂盒中未含材料

Ø 1.5 mL 无菌离心管

Ø PCR 八联管或 96 qPCR

Ø 1000 μL100 μL10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头

Ø UNG 酶(确定使用前建议验证酶效果

n  相关设

Ø 荧光定量 PCR 仪

Ø 1000 μL100 μL10 μL 移液枪

n 操作过程

v Porcine DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备

Porcine  DNA  定量参考品浓度标注于管壁标签上,请确认浓度后再进行稀释。

用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 Porcine DNA 定量参考品进行梯度稀释,稀释浓度依次为 30 ng/μL、3 ng/μL、300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL,30 fg/μL。具体操作如下:

1.       将试剂盒中的Porcine DNA 定量参考品和DNA 稀释液置于冰上或2-8℃条件下融化。待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3~5 s,如此重复 3 次。

2.       取 7 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5, ST6。

3.       在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 Porcine DNA 定量参考品稀释至 30 ng/μL,振荡混匀后短时间快速离心 3~5 s,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。

4.       在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6 管中分别加入 90 μL DNA 稀释液。

5.       按表 2 依次进行 6 次稀释操作。

image.png

 

已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8℃。

若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37℃条件下进行孵育。

标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。

v 加样回收质控 ERC 的制备

根据需要设置 ERC 中的 Porcine DNA 加样浓度(以制备加 30 ng Porcine DNA 量的样品 ERC 为例),具体操作如下:

1.    取 100 μL 样品基质溶液(或 DNA 稀释液)加入 1.5 mL 干净的离心管中,

2.    再加入 10 μL ST1,混匀,标记为样品 ERC。

样品 ERC 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成样品 ERC 纯化液。

v 阴性质控 NCS 的制备

根据实验设置阴性质控,具体操作如下:

1.取 100 μL DNA 稀释液加入 1.5 mL 干净的离心管中,标记为阴性质控 NCS。  阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

v qPCR 反应液的准备

1.       根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复孔/样。

反应孔数=(6 个浓度梯度的标准曲线+ 1 个无模板对照NTC+ 1 个阴性质控NCS +待测样品)×3

2.       根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量(含有 2 孔的损失量):

qPCR MIX =(反应孔数+2)× 20 μL

3.       各试剂放在冰上或 2-8℃条件下融化,并参考表 3 所示准备 qPCR MIX:

image.png

v 加样

1.       各试剂置于冰上,轻微振荡混匀,按表 4 所示加样:

image.png

加样完成后每孔总体积为 30 μL。

image.png

 

该示例表示的是检测各浓度梯度的 DNA 标准曲线(ST1~ST6)、1 个无模板对照 NTC、5 个待测样品(S1~S5)和每个样品的 ERC(S1 ERC~S5 ERC)、1 个阴性质控样品 NCS。每个检测做 3 个重复孔。

实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。

2.       将 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。

v qPCR 程序设置

² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.    点击“实验向导”。

2.    “孔板编辑”页面中选择步骤 1:选择反应孔。

3.    选择步骤 2:选择项目中的“猪源残留 DNA”程序。

4.    “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。

² 其他定量 PCR 检测系统程序设置如下:

1.    创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2.    创建新检测探针,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选)。

3.    设置两步法反应程序:25℃ UNG 酶作用 10 min(可选);95℃预变性 10 min; 95℃ 15 s,60℃ 40 s(读取荧光),40 个循环;反应体积 30 μL。

各实验室可根据所用机型设置合理的反应程序。

若检测体系里加入 UNG 酶,反应程序需要设置一步 25℃ UNG 酶作用 10 min。

v qPCR 结果分析

1.       “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并在标品赋值中分别根据表 2 赋值,例如“猪源残留残留 DNA”设为 3000、300、 30、3、0.3、0.03,并且在相应的“样本名称”中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5、ST6。

2.       待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。

3.       在“实验分析”页面点击image.png,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。

4.       在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。

以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。

1.       在 Results 的 Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2.       在 Results 的 Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别赋值为 3000、300、30、3、0.3、0.03(含义为每孔的模板浓度,单位为 pg/μL),并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5、ST6。

3.       在 Results 的 Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name一栏中命名为 NTC、NCS、S1、S2、S3、S4、S5,之后点击图片1.jpg

4.       在 Results 的 Standard Curve 面板中,可读取各标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。

5.       在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。

6.       分析 IPC 的 Ct 值,待测样品的 Ct-IPC 均值与 NCS 的 Ct-IPC 均值在±1 个 Ct 值范围内。若样品 Ct-IPC 均值与 NCS Ct-IPC 均值相比明显增大,则表明样品可能有抑制。如同时测试加标样品,则优先考虑样品回收率结果,IPC 结果作为参考。

7.       阴性质控 NCS 的 Ct 均值应大于标曲最低浓度 Ct 均值,若经验证的定量限浓度低于标曲最低浓度,则 NCS 的检测值应小于定量限浓度。

8.       无模板对照 NTC 的检测结果应为 Undetermined 或 Ct 值≥35,或根据实验室自身验证结果设定具体标准。

上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

 

 

修订日期:2023 年 01 月 16 日

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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